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直到1890年代，冷冻干燥技术才真正进入工业化过程。Richard Altmann（理查德·阿尔特曼）开发了一种使植物和动物组织冷冻干燥的工艺，但是直到1920年代后期和1930年代，该工艺才被人们广泛注意到。
正是在这个时候，Tival和Elser申请了冷冻干燥系统，该系统在1909年Shackell发明了真空室之后得到了改进。 这项系统大大改善了冷冻和冷凝的步骤。随后，在1950年代和1960年代，随着消费者需求的变化，冷冻干燥技术开始在食品工业中得到更广泛的应用。
食品工业中冻干技术的应用，早期主要是用于军事口粮和为宇航员开发的食品。冻干食品相对更长的保质期使其能够满足军事和NASA的特殊需求。
早期尝试的“试管”餐食和“试管”零食，它们很难补充水分。这对于宇航员来说，冻干食物的再水化，为此带来了一项重大改进。
与风干（Air-drying，另一种常见的食物保存形式）相比，需要在空气中对物料进行热处理，在此过程中不会损失无聊品质。但是，风干会导致物理变化，包括物料收缩和微观结构被破坏，生化效应和化学反应。
当涉及微生物感染和变质时，食品保鲜也会出现问题。即使在低温环境下，微生物仍然会存在，这就是为什么必须正确包装和存储食物，以避免吸收水分的原因。
如今，冷冻干燥技术已用于多种常见食品中，包括冷冻干燥的速溶咖啡、冰淇淋、果蔬、肉类和肉类替代品等。该过程可用于生产需要“锁定”所需营养元素的优质食品。
