近日，中国水产科学研究院鲢鳝遗传育种创新团队在鲢种质资源精准鉴定方面取得重要突破。团队通过系统性技术攻关，成功构建了首个不同鲢品种的DNA指纹图谱、开发了鲢雄性特异性分子标记，并研发了用于基因型鉴定的“鲢芯1号”20K液相芯片。这一系列成果解决了长期困扰鲢育种实践中的品种混杂、早期性别鉴定困难和基因型鉴定成本高昂等瓶颈问题，为鲢种质资源精准鉴定、全基因组选育和良种创制等方面研究提供了高效的技术工具。
鲢是我国“四大家鱼”之一，养殖范围广、产业规模大。然而，在长期的生产实践中，鲢养殖面临着种质资源混杂、遗传纯度不高、精准鉴定困难等问题，给种质资源高效管理和良种推广带来了严峻挑战。针对这些问题，团队经过2年技术攻关，挖掘到367个能够有效区分长丰鲢、津鲢、长丰鲢2号新品系与普通鲢的SNP位点集合，在此基础上构建了首个不同鲢品种的DNA指纹图谱，并证实其可用于不同鲢种质资源的鉴定，填补了国内外缺乏鲢品种精准鉴定工具的空白，大幅降低了品种检测成本，提高了检测效率和精度，为鲢品种权保护和种业健康发展提供了坚实的技术保障。
在鲢的性别鉴定方面，以往早期鲢主要依赖组织切片、解剖性腺等方法进行性别鉴定，操作繁琐且对鱼体造成伤害，难以满足早期选择和种质资源管理的实际需求。为解决这一技术难题，团队利用雌雄个体重测序片段差异分析，成功筛选到一个长度为412bp的雄性特异性片段，将其开发为分子标记，并证实利用该片段引物的PCR扩增可实现对鲢遗传性别的准确、快速、无伤鉴定。该标记在雌雄个体间呈现稳定差异，鉴定准确率达100%。更重要的是，这一分子标记在不同发育阶段、不同规格及不同养殖群体的鲢中均能稳定应用，展现出良好的普适性与可靠性。此项技术的突破为鲢早期选择、种质资源管理及种群结构监测提供了重要的技术支撑，具有广阔的应用前景。
针对鲢的种质鉴定和育种过程中长期缺乏经济高效的基因型鉴定工具问题，团队整合来自全国25个群体中934尾鲢的重测序数据，挖掘高质量和功能性SNP位点，并利用cGPS技术构建了包含20909个SNP位点的20K液相育种芯片鲲丰鏈“鲢芯1号”，该芯片位点多态性高、基因组分布均匀、技术参数优良，并证实可用于不同鲢品种的群体遗传学分析和复杂经济性状的遗传定位和育种。“鲢芯1号”的研发为鲢种质资源鉴定和保护、遗传改良和优良新品种培育提供了高效的基因型鉴定工具，将有力支撑鲢全基因组选育和良种创新研究。
上述3款工具的研发得到大宗淡水鱼产业技术体系岗位科学家项目(CARS-45)、中国水产科学研究院基本科研业务费(2023TD36、2024JC0106、YFI202407)等的资助，相关成果“一种鲢品种特异性SNP分子标记组合、鲢的DNA指纹图谱及应用”“一种鲢性别特异性分子标记及其引物和应用”“一种鲢20K液相芯片及其应用”获得国家发明专利3项，并在国际期刊Aquaculture上发表了研究论文。
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